比較顯微鏡是一種特種光學顯微鏡，它自三四十年代問世以來，得到了廣泛的使用，特別是80年代以來，其運用領域從科研擴展到國民經濟許多相關領域。

比較顯微鏡可以用一個目鏡同時觀察到左右兩個顯微鏡下的標本像，從而能對它們進行宏觀及微觀上的比較，達到鑒定的目的。

比較顯微鏡屬于特種顯微鏡。它不僅具有普通顯微鏡的放大作用，而且能用一組目鏡同時觀察到左右兩個光學系統物方物體的像。并通過對接、切割、重疊、旋轉等手段，對兩個或兩個以上物體進行宏觀或微觀上的比較，以檢查、分析和鑒別它們在形式、組織、結構、色彩或材料上存在的微小差別，達到鑒別、比較的目的。隨著科學技術的發展和國民經濟各部門不同用戶的需要，比較顯微鏡逐步形成完整的系列，從放大倍率較低的普通比較顯微鏡到高倍率的生物、金相等常用比較顯微鏡，各類比較顯微鏡品種齊全。現代比較顯微鏡的功能集中了現代光學儀器的*新成果，與電子、信息、圖像處理等高新技術結合使用十分方便。高倍比較顯微鏡配備圖像監視器后，可以達到五千至一萬倍的放大倍率，比較顯微鏡一般設有攝像、攝影的計算機接口。通過數碼相機和CCD，可將顯微鏡的比較形象輸入監視器，多人觀察，共同研討；還可通過視頻打印機直接輸出彩色圖像，比較顯微鏡聯接計算機后，比較圖像可運用計算機處理，比較結果可以輸入電腦貯存或用彩色打印機輸出。

簡易比較顯微鏡為組合式，主要作生物比較顯微鏡，也可取下比較頭作普遍顯微鏡使用。雙目觀察系統，減輕使用者眼睛疲勞，視野更大舒服。能左右單視場、切割視場、重疊視場觀察。具有倍率校正機構，使左右系統倍率嚴格一致。比較顯微鏡是公安部門和其它需要比較觀察部門的理想工具。