在形態學研究中，一個常見的問題是如何獲取與細胞功能相關的各種定量檢測信息。如在組織化學和免疫組織化學技術中，制作了理想的標本，如何進行觀察才能客觀地獲得盡可能多的定量信息，這是學習顯微圖像分析術的目的。目前，組織化學和免疫組織化學只能解決某一物質存在于何處，而不能精確地確定此物質量的多少，所謂“量”包括顏色深淡、其所占的長度或面積等，借助于顯微圖像分析系統(microscope image analysis system)則可以有效地解決此問題。

顯微圖像分析儀，又稱顯微圖像分析系統，是隨著時代與科學技術的發展而產生的跨學科產物。它不僅能通過各種成像系統獲得圖像的幾何數據、光密度、灰度等信息，還可運用該系統進一步處理，通過數字的形式把標本中的各類信息精確地表達出來。

顯微圖像分析系統是光學、電子學和現代計算機技術相結合的產物，主要包括顯微鏡、計算機、圖像采集裝置、圖像處理與分析軟件等關鍵部件。在光學顯微鏡下看到的是光學圖像，而在圖像分析儀顯示屏上看到的是電子圖像，因此在顯微圖像分析中，整個系統*重要的工作就是要保證得到的電子圖像能精確地反映光學圖像，這個過程由圖像掃描器(攝像機)、顯像管和圖像處理機(計算機)來完成。圖像采集裝置主要包括CCD攝像機、圖像采集卡以及數碼攝像機。CCD攝像機和圖像采集卡需一同使用。CCD攝像機采集顯微鏡形成的模擬顯微圖像，即模擬信號，圖像采集卡有模/數轉換功能。經圖像采集卡將這些模擬圖像轉換為數字圖像，即數字信號．以便計算機的圖像處理與分析軟件能對其進行處理與分析。數碼攝像機是集CCD攝像機和圖像采集卡兩者功能于一身，其輸出的是顯微鏡視場的數字圖像，可直接用于處理與分析。